Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Top1mtQ8R4U6 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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Top1mtQ8R4U6 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Top1mtQ8R4U6 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Top1mtQ8R4U6 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Top1mtQ8R4U6 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Top1mtQ8R4U6 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Top1mtQ8R4U6 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Top1mtQ8R4U6 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Top1mtQ8R4U6 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Top1mtQ8R4U6 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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Top1mtQ8R4U6 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms