Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mtmr3Q8K296 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms