Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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