Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
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Usp20Q8C6M1 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Usp20Q8C6M1 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Usp20Q8C6M1 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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Usp20Q8C6M1 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Usp20Q8C6M1 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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