Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q8C1R3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C1R3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C1R3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C1R3 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C1R3 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C1R3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms