Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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FarsaQ8C0C7 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms