Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWR4

Usp40, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

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Length 1,235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40Q8BWR4 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usp40Q8BWR4 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Usp40Q8BWR4 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Usp40Q8BWR4 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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