Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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