Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
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Pcsk9Q80W65 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
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Pcsk9Q80W65 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Pcsk9Q80W65 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Pcsk9Q80W65 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Pcsk9Q80W65 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Pcsk9Q80W65 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Pcsk9Q80W65 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Pcsk9Q80W65 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Pcsk9Q80W65 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Pcsk9Q80W65 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Pcsk9Q80W65 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
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Pcsk9Q80W65 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms