Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms