Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms