Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms