Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms