Protein–RNA interactions for Protein: Q7M764

Usp17le, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein E, mousemouse

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17leQ7M764 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp17leQ7M764 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp17leQ7M764 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp17leQ7M764 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp17leQ7M764 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp17leQ7M764 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp17leQ7M764 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Usp17leQ7M764 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp17leQ7M764 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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