Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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