Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms