Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Usp49Q6P9L4 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Usp49Q6P9L4 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp49Q6P9L4 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Usp49Q6P9L4 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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