Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms