Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms