Protein–RNA interactions for Protein: Q64092

Tfe3, Transcription factor E3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfe3Q64092 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Tfe3Q64092 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Tfe3Q64092 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tfe3Q64092 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms