Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Ints5-203ENSMUST00000191089 568 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Rce1-203ENSMUST00000224707 1255 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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AtrxQ61687 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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AtrxQ61687 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm12072-201ENSMUST00000118293 715 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Cacna2d3-208ENSMUST00000225985 918 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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