Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
JrkQ60976 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms