Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.6 ms