Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Urb1Q571H0 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms