Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms