Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Tmem253Q3UNB8 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Tmem253Q3UNB8 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Tmem253Q3UNB8 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Tmem253Q3UNB8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Tmem253Q3UNB8 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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