Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms