Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms