Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms