Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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