Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms