Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms