Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms