Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Traf3ip1Q149C2 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Traf3ip1Q149C2 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Traf3ip1Q149C2 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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