Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms