Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.7 ms