Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms