Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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