Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms