Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GscQ02591 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GscQ02591 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GscQ02591 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
GscQ02591 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
GscQ02591 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
GscQ02591 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
GscQ02591 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
GscQ02591 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
GscQ02591 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
GscQ02591 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
GscQ02591 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
GscQ02591 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
GscQ02591 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
GscQ02591 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
GscQ02591 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
GscQ02591 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
GscQ02591 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
GscQ02591 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
GscQ02591 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
GscQ02591 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
GscQ02591 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
GscQ02591 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
GscQ02591 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
GscQ02591 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
GscQ02591 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
GscQ02591 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
GscQ02591 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
GscQ02591 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
GscQ02591 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
GscQ02591 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
GscQ02591 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
GscQ02591 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
GscQ02591 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
GscQ02591 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
GscQ02591 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
GscQ02591 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
GscQ02591 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
GscQ02591 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
GscQ02591 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
GscQ02591 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms