Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms