Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SmsP97355 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SmsP97355 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SmsP97355 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SmsP97355 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SmsP97355 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SmsP97355 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SmsP97355 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SmsP97355 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SmsP97355 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SmsP97355 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SmsP97355 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SmsP97355 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SmsP97355 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SmsP97355 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SmsP97355 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SmsP97355 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SmsP97355 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SmsP97355 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SmsP97355 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms