Protein–RNA interactions for Protein: P83510

Tnik, Traf2 and NCK-interacting protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnikP83510 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnikP83510 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnikP83510 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnikP83510 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnikP83510 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnikP83510 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnikP83510 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnikP83510 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TnikP83510 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnikP83510 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnikP83510 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnikP83510 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TnikP83510 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnikP83510 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnikP83510 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnikP83510 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnikP83510 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnikP83510 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnikP83510 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnikP83510 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnikP83510 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnikP83510 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnikP83510 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TnikP83510 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnikP83510 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnikP83510 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnikP83510 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnikP83510 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnikP83510 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TnikP83510 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnikP83510 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnikP83510 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnikP83510 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TnikP83510 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnikP83510 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnikP83510 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TnikP83510 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnikP83510 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnikP83510 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnikP83510 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnikP83510 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnikP83510 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnikP83510 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnikP83510 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnikP83510 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnikP83510 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnikP83510 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnikP83510 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TnikP83510 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnikP83510 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnikP83510 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnikP83510 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnikP83510 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TnikP83510 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TnikP83510 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnikP83510 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnikP83510 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnikP83510 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnikP83510 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnikP83510 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnikP83510 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnikP83510 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnikP83510 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnikP83510 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms