Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx1P81068 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx1P81068 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx1P81068 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx1P81068 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Irx1P81068 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms