Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Decr1-201ENSMUST00000029877 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Zfp672-202ENSMUST00000064786 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 1700055D18Rik-202ENSMUST00000186030 3720 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Grik1-211ENSMUST00000228188 3221 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Mmp9-201ENSMUST00000017881 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Irx2P81066 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Irx2P81066 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
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Irx2P81066 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Irx2P81066 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Irx2P81066 Carhsp1-201ENSMUST00000008537 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Kcnj5-202ENSMUST00000214223 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Irx2P81066 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Irx2P81066 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Ovgp1-201ENSMUST00000000573 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms