Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Tp53bp1P70399 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Tp53bp1P70399 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Tp53bp1P70399 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
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Tp53bp1P70399 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Tp53bp1P70399 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Tp53bp1P70399 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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