Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms