Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 AC171003.1-201ENSMUST00000221667 1665 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Mynn-201ENSMUST00000047502 3394 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Arhgap19-202ENSMUST00000163265 5058 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Gm16204-201ENSMUST00000117864 1897 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Gm4451-201ENSMUST00000186000 1891 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Stam-201ENSMUST00000028050 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Gm10600-201ENSMUST00000117202 2047 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Gm44951-201ENSMUST00000206449 2024 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Bcor-201ENSMUST00000043441 6113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Cel-201ENSMUST00000028161 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Anapc1-203ENSMUST00000110333 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Phka2-204ENSMUST00000112380 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rps28P62858 A230056P14Rik-201ENSMUST00000130189 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Olfr169-202ENSMUST00000215040 2316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Tfdp1-203ENSMUST00000209396 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Creb5-202ENSMUST00000203487 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Zkscan1-202ENSMUST00000066617 8042 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Sorbs1-202ENSMUST00000099467 2817 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Sipa1l1-205ENSMUST00000220963 5907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Nedd4l-201ENSMUST00000080418 3326 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 1300002E11Rik-201ENSMUST00000180830 3557 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Celf2-223ENSMUST00000182851 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Adgrl2-213ENSMUST00000199059 4637 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Zmym5-203ENSMUST00000173954 5357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Cacna1c-206ENSMUST00000185345 6579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Hdac4-202ENSMUST00000097644 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Tmem106a-202ENSMUST00000100403 2428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Epb42-202ENSMUST00000102490 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Mast2-202ENSMUST00000106484 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Gpr75-201ENSMUST00000109430 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Etl4-205ENSMUST00000114607 3055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Synj2-207ENSMUST00000115788 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Gm45903-201ENSMUST00000212891 2898 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 AC160562.1-201ENSMUST00000216170 3468 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Trpc7-201ENSMUST00000022023 3483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Gm46404-201ENSMUST00000221461 4114 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 AC163040.1-201ENSMUST00000222979 4288 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Nufip1-201ENSMUST00000022586 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Pigr-201ENSMUST00000027675 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Cldn8-201ENSMUST00000049697 2356 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Cd14-201ENSMUST00000061829 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Sec14l3-201ENSMUST00000068322 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Npy5r-201ENSMUST00000070810 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Glul-201ENSMUST00000086199 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Bbx-208ENSMUST00000138166 8743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Slco5a1-207ENSMUST00000188454 8463 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Wdr76-203ENSMUST00000110602 4170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Tmod3-201ENSMUST00000072232 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Mfsd11-201ENSMUST00000021173 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Gm1559-201ENSMUST00000219596 3117 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Pes1-202ENSMUST00000109985 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Pes1-201ENSMUST00000020705 2911 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Flna-203ENSMUST00000114299 8456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Nfia-203ENSMUST00000092532 9382 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Tirap-201ENSMUST00000175765 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Gm37949-201ENSMUST00000192808 2091 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps28P62858 Mtmr6-203ENSMUST00000224366 1968 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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