Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smg6P61406 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg6P61406 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg6P61406 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg6P61406 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg6P61406 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smg6P61406 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC16■□□□□ 0.15
Smg6P61406 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smg6P61406 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smg6P61406 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smg6P61406 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smg6P61406 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms