Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Samsn1P57725 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Samsn1P57725 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Samsn1P57725 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms